曾纪泽得知石达开已经死后，西南已经无后患，便开始了自己的大布局。曾纪泽的打算，是要在剿灭太平天国之前，湘军和淮军控制东南半壁江山，包括江苏、广东、广西、安徽、湖北、湖南、浙江等地，然后赶李秀成北上，随之挺进中原。
本来九洑洲的陷落，就已经意味太平军从江北扬州一带运粮往天京的通道被彻底阻断，天京本来就很严重的粮食问题变得越发严重了，城里十几万人每天饿死不少。
本来掐断太平军北路运粮通道后，曾国藩让曾纪泽和彭玉麟着手切断南路，也就是溧水、高淳一线的太平军粮道。
但就在这时候，淮北一带又陷入了混战之中。之前谋害陈玉成，投降清廷的苗沛霖，再次举起反清大旗，在淮北一带到处攻城略地。苗沛霖之所以多次反叛仍能逃过覆灭的命运，最根本的原因就是因为胜保、僧格林沁这些满蒙将领对他采取纵容的态度。对于胜保、僧格林沁来说，苗沛霖集团是阻挡湘军势力北进中原的重要力量。所以，他们一直不希望苗沛霖被湘军消灭。
“父亲，现在围攻金陵，有九叔的吉字营就足够了。安徽是淮军的大本营，我可带淮军去消灭苗沛霖，稳定安徽的局势。“曾纪泽向曾国藩主动请缨，北上消灭苗沛霖，扫除湘军日后进军中原的障碍。
曾国藩说：“苗沛霖这逆贼不可靠，我以前一直主张要剿灭，为此还参倒了安徽巡抚翁同书，可惜朝廷一直被胜保等人蒙蔽。”
曾纪泽说：”我听说胜保平生最仰慕的一个人，就是为雍正所杀的年羹尧。他被朝廷诛杀也是迟早的事。苗沛霖不会再有靠山了。“
曾国藩不知曾纪泽还有自己的计划，便同意了曾纪泽的提议，让他带淮军去平叛。
果然不出曾纪泽所料，胜保很快就被慈禧诛杀。
苗沛霖与胜保有交结，看看洪军自安庆一破，大势不妙，把穷无所归的陈玉成做人情，缚送胜保大营。胜保喜不可言，一面接收了陈玉成的有国色之称的妻子，一面在奏折中大事铺张，以为陈玉成是洪军的第一勇将，既已被擒，洪军从此不足忧，意思中要亲送陈玉成入京，举行“献俘大典”。结果弄了个很大的没趣，朝廷批答，申斥他胡闹，同时命令，即在军前正法。好大喜功的胜保，大失所望，从此对朝中柄政的大臣，越发不满。
1863年，胜保受命为钦差大臣，督军入陕，飞扬跋扈。在西安的时候，有个副都统叫高福，不知怎么，出言顶撞了他。胜保大怒，命令材官打高福的军棍，高福大为骇异，说是同为二品官职，你如何能打我？胜保冷笑答道：“我是钦差大臣，以军法杀你都可以，何况是打军棍？”
胜保这个钦差大臣，行军仿佛御驾亲征。每天吃饭，仿传膳的办法，每样菜都是一式两碗，那样菜好，便传谕，拿这样菜赏给某文案，居然上方玉食的赐膳之例。入陕之初，为了区区一味韭黄，曾杀过一个厨子。
更让慈禧不能忍受的是，胜保的奏折，常常自己起稿，有几句常用的话：“古语有云：‘阃以外将军治之’，非朝廷所能遥制。”还有一句话是：“汉周亚夫壁细柳时，军中但闻将军令，不闻天子诏。”那是汉文帝时的故事。胜保常在奏折中提到这话，等于说军令高于诏令，已犯大忌，而且也有藐视太后妇人，皇帝童稚的意。因此，湖北巡抚严树森参他“观其平日奏章，不臣之心，已可概见”，从而以为“回捻癣疥之疾，粤寇亦不过支体之患，惟胜保为腹心大患”。
曾国藩也开始弹劾胜保，当时京内京外，很多人弹劾胜保“冒功侵饷，渔色害民”。胜保的好色是出名的，随军的侍妾有三十多个，最得宠的，竟然是“英王”陈玉成的漂亮妻子，陈玉成死后，胜保见她姿色不错，强占了她。
胜保的侵饷也是有名的。那时的军饷，多靠比较平靖的各省支援，称为“协饷”，某省解某省若干，朝廷规定了数目，但各自为政，实际上协饷的多寡迟速，要看封疆大吏与钦差大臣间的私人交情。胜保骄恣狂妄，与各省督抚，多不和睦，所以协饷常不能按时收到，偶然有一笔款子到了，他百事不问，信手挥霍个够，剩下的才拨归军用。一次官军在同州遇伏大败，死伤枕藉，一个姓雷的带兵官，跪在他面前，痛哭流涕，要他发钱抚恤，但实在没有钱，以致他的受伤的部下，睡在辕门外，呻吟彻夜。
慈禧本来顾念胜保在辛酉政变诛肃顺时立过大功，准备就陕甘总督或者陕西巡抚这两个缺，挑一个给他。但胜保有一天醉酒，竟然夸耀说当年辛酉政变在热河自己摸过慈禧的小手，在她的身上战斗过，并且放言，”唯纪辛酉间事，非保请太后垂帘并简近支亲王辅政，则诸公何以有今日？“
慈禧闻讯大怒，但怕胜保造反，于是决定先解除了他的兵权，把他骗到京师然后治罪。但当时陕西还很乱，河南的大股捻匪，也正在往西窜扰，关系到陕西、山西、河南三省的安危。于是慈禧命令在豫西浙川的多隆阿，兼程北上，援救潼关，另外颁了一道密旨，封交多隆阿亲自开拆，遵旨行事。
胜保感觉不对劲，他没有自己的嫡系部队，事急无奈，派了个提督，拿了用督办陕西军务钦差大臣关防所发的护照，调苗沛霖所部到陕西助剿。
消息一传，安徽、江苏、山东、河南各地负有治安责任的地方官和带兵官，无不大起恐慌，飞章告警。因为苗沛霖正苦监视太严，动弹不得，经胜保檄调到陕，恰好给了他一个窜扰的机会。于是军机处搞得手忙脚乱，用六百里加紧的廷寄，“严饬胜保速行阻止”，同时分别命令僧格林沁及有关各省的大员，阻拦苗沛霖，“妥为开导，刚柔互用。如不听阻止，即着分拨兵勇，并力兜剿，毋许一人一骑，闹入境内。”
曾国藩除了派曾纪泽去拦截苗沛霖，还将李续宜部调归他指挥。曾纪泽比较满意，李续宜一向在皖北打仗，地形极熟，苗沛霖对他相当忌惮。后来调到湖北，当胡林翼病重时，曾国藩专折保荐他接任，不久，由湖北调为安徽巡抚，用意就在责成他专门对付苗沛霖。到任不久，丁忧奏请开缺，尚未期满。现在因为胜保的荒唐，怕苗沛霖蠢动，所以曾国藩请特旨催促：“克日启程赴皖任事，断不可拘泥假期未满，稍涉迟延，致皖省大局，或有变迁贻误。”
为了胜保的轻举妄动，惹起了极大的麻烦，朝中大臣，各省大吏，无不对他深恨痛绝，皆曰可杀！于是各处弹劾密告胜保的章奏文书，又如雪片飞到。恭亲王派了专人处理，把那些文件分别处理，虽有少数夸大其词，意在报复的，但大致都可信其实在，因为一项劣迹，常有几个人指出，经过仔细比对，逐条开列，总计有十来款之多。
军机大臣会商的结果，采纳了文祥的主意，向僧格林沁查问，奏准两宫太后，随即下了一道密谕：
“前有人奏：胜保去春督师京东，以至入皖，入陕，所过州县，非索馈千金或数千金，不能出境，稍有羁留，官民尤困。随营之妓甚多，供亿之资不少。又有人奏：胜保上年督兵直隶，路过衡水，悦民间女子，招至营中阅看。又纵容委员，滥卖‘功牌’，至今直省拿获马贼，多带有胜保营中蓝翎或花翎，以及顶戴执照。又有人奏：胜保以一寒士，自带兵以来，家资骤富，姬妾众多，揆厥由来，总由滥保人员，以取贿赂；虚报名额，以冒口粮；勒派捐税，以充私囊。本年督兵赴皖，挈带眷属，熄赫道路；其拔营赴陕，同行女眷大轿有数十乘，闻“四眼狗”陈玉成家眷，亦为胜保所有，随从车辆，不知多少？各州县不胜苦累等语。以上胜保贪渔欺罔各劣款，系近日节次有人参奏，情节大同小异，似非虚罔。僧格林沁久驻河南、安徽交界处，见闻自必较确，着即按照所参各款，据实复奏。”
以外还有陕西绅士的“公禀”，是由多隆阿抄呈的。这些公禀是要求多隆阿回陕西去平回乱，当然也就提到了胜保，除去贪污、好色的劣迹以外，还指出“讳败为胜”，说渭河北岸，“匪巢林立”，西路凤翔，东路同州，而胜保安坐省城，捏造获胜的战报。
恭亲王原来还把胜保当成自己制衡慈禧的筹码，想袒护他，这才明白，中原的局势，比想象中要严重得多。于是，军机处按照太后懿旨，布置是以僧格林沁为第一线，这一线在河南如果挡不住苗沛霖，那就要靠多隆阿扼守潼关。此地自古就是一夫当关，万人莫敌的重险，多隆阿如果不能及时赶到，后患不堪设想。而多隆阿的全部兵力不到七千人，从紫荆关北上，且战且走，星夜疾驰，赶往潼关。
这时的胜保，到同州、朝邑一带视察了一番，已经回到西安，还在要兵要饷。亲自动手的奏折，已不是“非朝廷所能遥制”的话了，改了一个说法：“先皇帝曾奖臣以‘忠勇性成，赤心报国’，”这是指英法联军内犯时，胜保曾在通州“与洋人接仗”而言。接下来便铺叙他这次同州之行的战功，说是一个名叫王阁村的地方，为回匪老巢，进剿大胜，得意洋洋地写道：“臣抵同未及三日，获此全捷，差可壮我军威。”然后就提到军饷了，除了照例指责各省协饷，未能如数拨解，兵勇口粮，积欠累累以外，因为关中已是“西风吹渭水，落叶满长安”的季节，特意加了一笔：“现在天气日寒，兵丁时虞饥溃。”另外加了三个“附片”，一个是参奏署理陕西藩司刘齐衔筹饷不力，办事玩忽；一个是奏请开复三名革职人员的处分，随营效力；再一个是请催新任西安将军穆腾阿迅即赴任，并帮办陕西军务。
等这个奏折到京，僧格林沁奉旨查明胜保劣迹的复奏也到了，不但上谕中所指出的几条，都是事实，另外还查出了许多秘密。最骇人听闻的是，陈玉成的两个弟弟被捕送到胜保军营，献上金银数千两之多。胜保得了这么一笔丰厚的贿赂，全力庇护，饶了那两个“要犯”的命，并还派在营里当差。
这个秘密的揭露，不下于胜保擅调苗沛霖入陕。当即以紧急驿递，分饬僧格林沁和多隆阿遣派专人访查详情，同时再一次催促多隆阿星夜兼程，说他早一日到潼关，便可早一日“抒朝廷西顾之忧”。
多隆阿派人安抚各营，申明朝廷只抓胜保一个，有些平日倚仗胜保的势力，为非作歹，自知迟早难逃逮问的命运，依旧不敢出面。
多隆阿传旨宣布胜保罪状，褫职逮京，交刑部治罪，抄了他的家。慈禧力主杀掉胜保，那天对恭亲王说：“封疆大吏，守土有责，不能与城共存亡，说是为了整饬纪纲，办他的死罪，话是不错，可是人家何桂清到底不过一个文弱念书人，听见长毛来了，吓得发抖，也不算是件怪事。倒是胜保——如今什么年头儿？他还在学年羹尧，把朝廷当作什么看了，这不是怪事吗？”
“是！”恭亲王已经会意，知道慈禧要杀胜保，于是说：“臣等敬聆懿旨。”
慈禧咳嗽了一声，道：“你们商量着办吧！”
慈禧这一态度，让恭亲王觉得，胜保不能就这么死了，太便宜他了，要让胜保在刑部火房中住些日子再说。
退朝后，恭亲王和军机大臣文祥一路走，一路谈，不胜感慨：“胜保事事要学年大将军，没想到下场也跟年羹尧一样啊，自作孽，不可活。”
慈禧杀了胜保，曾纪泽便再无顾忌，下令对苗沛霖的部下展开围剿，将他赶往了蒙城。
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